檢驗(yàn)者對(duì)毛發(fā)和纖維的完成顯微比對(duì)比mtDNA分析更快，因此顯微比較可作為一種有效的篩選手段來減少需進(jìn)行mtDNA測(cè)序的物證數(shù)量。通過比較后發(fā)現(xiàn)，毛發(fā)顯微篩查和線粒體DNA檢驗(yàn)這兩種技術(shù)是互補(bǔ)。

     由于在提取過程會(huì)破壞毛發(fā)，因此在mtDNA檢驗(yàn)之前先由檢驗(yàn)者進(jìn)行毛發(fā)的物理檢驗(yàn)。尤其對(duì)毛干分析，常利用組織研磨破壞毛發(fā)的角蛋白，使之釋放出mtDNA分子。通常在仔細(xì)清洗毛發(fā)表面后剪取1～2cm的毛干進(jìn)行檢驗(yàn)。

     通過比較頭部、外陰、腋窩的毛干，發(fā)現(xiàn)頭部毛干的成功率最高，在反應(yīng)體系中加入小牛清可以減少Yoshii及Wilson等人（1995）DNA中提取到的黑色素對(duì)PCR的抑制效應(yīng)。巢式PCR擴(kuò)增能成功地從33～330fg的基因組DNA中獲得mtDNA序列信息。

     在親子鑒定中在毛發(fā)樣本中一般都要求5歲以上的人帶毛囊的頭發(fā)5根，其主要是毛囊部分含有核DNA，對(duì)于核DNA的檢測(cè)技術(shù)成熟穩(wěn)定，相對(duì)于mtDNA檢測(cè)費(fèi)用低。毛干部位含mtDNA也可以檢測(cè)，但一般是建議采集的。只有刑事案件在不得以的情況下才考慮這種特殊的樣本作為檢材用。