Y-STR多態(tài)性是父系遺傳，因此在父權(quán)親子鑒定中具有實際意義。Y-STR在父子關(guān)系親子鑒定中的平均排除概率和個人識別概率是相同的。因此，多Y-STR座位連鎖的多態(tài)性與常染色體基因座比較，具有較高的排除能力。Y-STR的父系遺傳特征在被指控的父親已不在的親權(quán)關(guān)系親子鑒定中，可能提供有用的相關(guān)信息，例如被指控的父親已經(jīng)去逝，可以考慮采用該家庭中同一父系的男性親屬血樣代替他做實驗，提供關(guān)于他的Y染色體STR基因座全部信息。