DNA分子標記是能反映生物個體或種群間基因組中某種差異特征的DNA片段。此DNA片段是將基因組DNA經(jīng)過限制性內(nèi)切核酸酶切割和分子雜交或PCR擴增后在電泳凝膠上（或雜交膜上）檢測到的。與前三種遺傳標記相比，DNA分子標記具有諸多優(yōu)點，包括：

    1 能對生物各發(fā)育時期的個體、組織、器官和細胞進行檢測，直接以DNA的形式表現(xiàn)，不受環(huán)境影響，不存在基因表達與否的問題；

    2 數(shù)量豐富，遍及整個基因組；

    3 遺傳穩(wěn)定，多態(tài)性高；

    4 對生物體的影響表現(xiàn)為“中性”，不影響目標形狀的表現(xiàn)，與不良性狀無必然連鎖；    

    5 多為顯性，能為鑒別純合基因型和雜合基因型提供完整的遺傳信息；

    6 操作簡便等。

    這些優(yōu)點使其廣泛地應用于生物基因組研究、進化分類、遺傳育種、醫(yī)學和法學等方面，成為分子遺傳學和分子生物學研究與應用的主流技術(shù)之一，并且對社會產(chǎn)生巨大沖擊。目前，被廣泛應用的DNA分子標記主要有RFLP（限制性片段長度多態(tài)性）、RAPD（隨機擴增多態(tài)性DNA）、AFLP（擴增片段長度多態(tài)性）、STS（序列標記位點）、SSR或SSLP（簡單重復序列）和DNA指紋技術(shù)等。

    親子鑒定技術(shù)就是DNA分子標記的應用，專業(yè)稱之為STR（短串聯(lián)重復序列）分型檢測。