80年代以前，法醫(yī)學鑒定采用血型遺傳標記。常規(guī)血型系統(tǒng)有以下共同點：①均有明確的表型分布；②等位基因數(shù)不多；③表現(xiàn)型分型明確，表現(xiàn)型與基因型之間的關系以及遺傳特征明確；④基因頻率分布具有離散型隨機變量的特征。但DNA紋印與以往應用的血型遺傳標記有不同的特點：①在小衛(wèi)星VNIR基因座，等位基因之間是DNA片段長度上的差異，等位基因長度依據(jù)重復單位數(shù)目；②DNA紋印的等位基因數(shù)多，相差一個重復單位就是一個等位基因，一個基因座上的等位基因數(shù)可達數(shù)十，甚至數(shù)百，等位基因數(shù)遠多于任何血型系統(tǒng)；③基因頻率分布呈連續(xù)隨機變量特征。目前DNA紋印檢測采用瓊脂糖凝膠電泳分離方法，分辨率有限。肉眼觀察DNA圖譜，片段間相距Imm才能明確判定為兩侖基因，在低分子量區(qū)段這Imm相當于50bp差異，在高分子量區(qū)段則相當于200bp。如果兩個等位基因片段長度差距小于此分辨率時，紋印圖上只能觀察到一條帶。因此在常規(guī)的瓊脂糖凝膠上不可能分辨出多達數(shù)十或數(shù)百的等位基因片段。形成連續(xù)基因頻率分布的另一原因是片段長度測量誤差。在DNA紋印圖上是以片段遷移距離確定片段長度，根據(jù)同一凝肢中的標準分子量標記片段的遷移率來計算待測片段長度，遷移距離測量不可避免地會出現(xiàn)誤差。所以單基因座DNA紋印的群體調(diào)查不能完全準確地確定等位基因以及基因頻率分布。所測得的等位基因數(shù)是一個連續(xù)隨機變量，基因頻率分布也是一個變量。