DNA鑒定-三種DNA提取方法
2020-11-04 22:36:20 來源: 法醫(yī)物證學(xué)
(一)QIAGEN法
采用QIAGEN公司的QIAamp@ DNA mini and blood mini提取試劑盒,經(jīng)過蛋白酶K消化、硅膜過濾、洗滌雜質(zhì)與DNA洗脫幾個步驟后可以得到純度較高的DNA。具體操作步曩蟹下瞬述:
1)在脫蠟后的待檢樣本中加入180μl Buffer ATL,另加20μl蛋白酶K,搖勻置56℃中孵育消化直至組織完全消化,液體呈清亮為止。
2)加200μl AL緩沖液置70℃裂解10min。
3)加200μl乙醇(96%~100%)振蕩混勻。
4)在離心機(jī)上稍作離心后,將全部液體小心轉(zhuǎn)移到硅膜層析柱上,以6000g (8000r/ min)離心2min,棄收集液。
5)將硅膜層析柱移至另一干凈收集管上,小心加入500μl AW1緩沖液,以6000g (8000r/min)離心2min,棄收集液。
6)將硅膜層析柱移至另一干凈收集管上,小心加入500μl AW2緩沖液,以6000g (8000r/min)離心2min,棄收集液。
7)再以20 000g (14 000rlmin)離心3min以使硅膜完全干透。
8)將硅膜層析柱移至一普通離心管(1. 5ml)上,加20~100μl TE緩沖液將結(jié)合在硅膜上的DNA洗脫。甲醛固定組織的洗脫液體積為200yl,2片石蠟包埋組織的洗脫液體積為100μl,H.E染色切片組織的洗脫液體積為50μl。
9)在室溫(15~25℃)條件下靜置約1min,以20 000g (14 000r/min)離心1min,收集DNA洗脫液。
(二)IQ法
采用Promega公司的Tissue and Hair Extraction Kit (for use with DNA IQTM)提取試劑盒,經(jīng)過蛋白酶K消化、磁化樹脂結(jié)合(磁化架)、洗滌純化(lysis buffer,3次)和DNA洗脫(Elution buffer 100μl,65℃)四個步驟可完成DNA提取,操作過程如下所述。
1)在脫蠟后的待檢樣本中加入200μl含有蛋白酶K(1.8mg/ml)和DTT (0. Imol/L)的孵育緩沖液(IB),搖勻,置于56℃中孵育消化,直至組織完全消化,液體呈清亮為止。
2)加400μl消化緩沖液(lysis buffer)。
3)加14μl樹脂(Resin),振蕩混勻,置于室溫5min后再振蕩2s立即放置在磁化架上結(jié)合,移除多余液體。
4)再加100μl含有DTT (0.01mol/L)的消化緩沖液(lysis buffer),振蕩2s立即放置在磁化架上結(jié)合進(jìn)行洗滌純化。重復(fù)3次。
5)在磁化架上將樹脂(Resin)嘹干5min,加20~100ul洗脫緩沖液(EB)振蕩后置65℃5min,然后振蕩2s后立即放置在磁化架上,收集液體DVA。
(三)Chelex-100法
1) 56℃消化(200μl 5%Chelex,40μl 10mg/μl蛋白酶K,8μl 1mol/L DTT) 至溶液清澈。
2)劇烈震蕩5 5~10s。
3)沸水煮8min。
4)劇烈振蕩5~10s; 14000r/min離心5min;取上清液用于擴(kuò)增反應(yīng)。
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