1993年，美國邪教大衛(wèi)教派(Branch Davidian)在得克薩斯州韋科鎮(zhèn) (Waco，Texas)點燃的大火燒死了86人，法庭醫(yī)學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)(The Forensic Science Service)在處理遇難者遺骸DNA的時候發(fā)現(xiàn)，原有STR技術(shù)對于這些降解的DNA分型結(jié)果很不理想，而選用更小片段的STR位點，則可以在4位點復(fù)合擴(kuò)增體系中得到更好的結(jié)果。
Butler等(1998)運用飛行時間質(zhì)譜技術(shù)使得STR等位基因可以在沒有等位基因階梯標(biāo)準(zhǔn)( allelic ladder)比對的情況下正確分型，這就為那些較小的PCR產(chǎn)物的STR分型提供了技術(shù)支持。Hellmann等(2001)利用所設(shè)計的新引物對頭發(fā)進(jìn)行HUMFES、HUMTH01和HUMTPOX位點的擴(kuò)增。引物的退火結(jié)合位置非常接近STR位點的重復(fù)單位，擴(kuò)增產(chǎn)物長度大大縮短(HUMFES<106bp，HUMTH01<86bp，HUMTPOX<87bp)，頭發(fā)STR位點擴(kuò)增成功率明顯提高。
2001年，“9·11”恐怖事件造成2700多人死亡，在對遇難者進(jìn)行尸源鑒定 時，采用了兩個新的STR復(fù)合擴(kuò)增體系(Holland et a1-，2003)。通過減小STR位點擴(kuò)增片段的大小，對這些分型有困難的法醫(yī)學(xué)樣品進(jìn)行基因分型。這個新技術(shù)有力地推動了遇難者個人識別工作的進(jìn)行，同時正式被命名為miniSTR技術(shù)。
2002年，Butler等開發(fā)了5個miniSTR復(fù)合擴(kuò)增體系，包括DNA聯(lián)合索 引系統(tǒng)(Combined DNA index system，CODIS)中的13個基因座，以及 D2S1338、Penta D和Penta E，它們與商品化STR試劑盒16基因座復(fù)合擴(kuò)增體 系可以進(jìn)行直接比較。但是，由于miniSTR位點的擴(kuò)增產(chǎn)物片段長度都很短， 其等位基因片段長度上有部分重疊，所以進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增的時候，每一種顏色的熒 光標(biāo)記一個位點。他們建立的5個miniSTR復(fù)合擴(kuò)增體系，每一個復(fù)合擴(kuò)增體 系包括3個位點，把其中兩個復(fù)合擴(kuò)增體系組合在一起成為“Big mini”(Chung et al，2004），每種顏色的熒光標(biāo)記的兩個STR基因座等位基因之間至少有20堿基的差距。比如，藍(lán)色熒光標(biāo)記，TH01位點最大的等位基因是98bp，而FGA位點最小的等位基因是125bp。
2003年至今，很多人開始了miniSTR的研究工作，Drabek等(2004)對 miniSTR復(fù)合擴(kuò)增體系與商品化STR試劑盒之闖的同一性進(jìn)行了研究；Chung等(2004)則研究了miniSTR對降解DNA模‘的擴(kuò)r'效率；Bode Technology Group合成了BodePlexl(D13 S317、D21Sll、D7S820、D16S539、CSFIPO)和BodePlex2 (TPOX、FGA、D7S820、D18~1)，這兩個復(fù)合擴(kuò)增體系在世界 貿(mào)易中心大廈遇難者的骨及組織的個體識鬟中發(fā)揮了垂常重要的作用。
