1 基因座
選用多態(tài)性基因座(如STR、SNP等類型)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其中,常染色體STR基因座宜符合如下要求:(1)經(jīng)過群體遺傳學(xué)調(diào)查,多態(tài)性高,非父排除率在0.7以上。(2)經(jīng)過500次以上減數(shù)分裂的家系調(diào)查,基因座的突變率在0.002以下。目前,建議采用商品化試劑盒進(jìn)行檢驗(yàn),檢測(cè)系統(tǒng)的累計(jì)非父排除率應(yīng)達(dá)到99.99%以上。除常染色體基因座外,建議在需要時(shí)增加Y-STR、X-STR的檢驗(yàn)。其中,Y-STR系統(tǒng)可選擇DYS456、DYS389I、DYS390、DYS389II、DYS458、DYS19、DYS385a/b、DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、
DYS392、Y GATA H4、DYS437、DYS438、DYS448等基因座進(jìn)行單倍型檢驗(yàn);X-STR系統(tǒng)可用GATA172D05、HPRTB、DXS6789、DXS6795、DXS6803、DXS6809、DXS7132、DXS7133、DXS7423、DXS8377、
DXS8378、DXS9895、DXS9898、DXS10101、DXS10134、DXS10135、DXS10074等。
2 擴(kuò)增試劑
建議選用商品化試劑盒(帶熒光標(biāo)記的PCR體系)。若選用其它來源的擴(kuò)增體系,須經(jīng)驗(yàn)證、認(rèn)可后方可用于日常檢案。每批檢驗(yàn)均應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)樣品(已知濃度和基因型的Control DNA)和(或)以前檢驗(yàn)過的、已知基因型的樣本作為陽性對(duì)照,以不含DNA的樣本作為陰性對(duì)照。
3 PCR體系與溫度循環(huán)參數(shù)
按試劑盒的操作說明書進(jìn)行。
4 擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)與結(jié)果的判讀
使用熒光分析儀,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳分析,使用等位基因階梯(Ladder)作為參照品來判別樣本的基因型,步驟方法按照儀器操作手冊(cè)。